药师如来虽是东方之佛,但广行菩萨道时,曾发利益众生的十二微妙上愿,愿所有闻名受持药师如来名号的有情众生,众病皆除,身心安乐,受用无穷,然后解脱忧苦,证得无上菩提,并依此愿修行而成佛,住在东方净琉璃世界。
药师法门间通显密,注重身心修持以及现世成就,认为所有的身体上的疾病不顺遂,皆由过去造作之恶因所显发的恶果。
相传药师如来与日光、月光菩萨本为父子,久远劫前曾于电光如来法运中勤修梵行,受电光如来咐嘱分别改名为医王与日照、月照,发无上菩提大愿,誓救六道一切有情出轮回苦。
「十二药叉大将」是药师如来的分身,或其眷属,是围绕于本尊的守护者,又称药师十二神将,是顺应药师如来之十二大愿而化现之羯摩神。《藥師琉璃光如來本願功德經》,爾時眾中有十二藥叉大將,所謂:
宮毘羅大將 伐折羅大將
迷企羅大將 安底羅大將
頞儞羅大將 珊底羅大將
因達羅大將 波夷羅大將
摩虎羅大將 真達羅大將
招杜羅大將 毘羯羅大將
诵持药师咒即药师琉璃光如来灌顶咒,能去除病苦,消灾延寿,免除九横死之灾,并能消除一切罪业,命终往生东方清净琉璃世界,永不退转,直至成佛。